A principios del año 2009 el Consejo de Dirección de la institución llegó al acuerdo de actualizar los protocolos de actuación existentes, teniendo en cuenta los avances en el diagnóstico y tratamiento de diferentes entidades, así como la incorporación de nuevas tecnologías de punta.
Asumiendo como primicia el cumplimiento de la ética profesional y la incorporación con posterior seguimiento de cada paciente a través de Protocolos de Investigación, lo cual caracteriza a la institución, así como la docencia altamente calificada de pregrado y postgrado, se diseñaron los objetivos en la confección de las que serían las nuevas Buenas Prácticas Clínicas, aprobadas posteriormente por los Consejos Científicos y de Ética de la Investigación del centro.
A continuación se citan los temas actualizados aprobados hasta el momento: